Lebih dari 5.000 jenis virus baru telah diidentifikasi di lautan dunia, menurut sebuah studi baru.
Peneliti studi menganalisis puluhan ribu sampel air dari seluruh dunia, mencari virus RNA, atau virus yang menggunakan RNA sebagai bahan turun temurun. Virus corona baru, misalnya, adalah jenis virus RNA. Virus-virus ini dipelajari dibandingkan dengan virus DNA yang menggunakan DNA Sebagai materi genetik, kata penulis.
Keragaman virus yang baru ditemukan begitu besar sehingga para peneliti menyarankan untuk menggandakan jumlah kelompok taksonomi yang diperlukan untuk mengklasifikasikan virus RNA, dari lima menjadi 10 filum saat ini. (Era adalah klasifikasi luas dalam biologi yang berada di bawah “kerajaan.”)
“Ada banyak variasi baru di sini – dan keragaman yang lengkap [new] Sebuah filum, Taraviricota, ditemukan di seluruh lautan, menunjukkan bahwa itu penting secara ekologis,” kata penulis utama studi Matthew Sullivan, profesor mikrobiologi di Ohio State University. Dia mengatakan dalam sebuah pernyataan (Buka di tab baru).
Terkait: Virus paling mematikan dalam sejarah
Menurut Sullivan, studi tentang virus RNA biasanya berfokus pada virus yang menyebabkan penyakit. (Beberapa virus RNA yang terkenal termasuk influenza, Ebola, dan virus corona yang menyebabkan COVID-19.) Tapi ini hanya “potongan kecil” dari virus RNA di Bumi, kata Sullivan.
“Kami ingin mempelajarinya secara sistematis dalam skala yang sangat besar dan menjelajahi lingkungan yang belum pernah dilihat siapa pun secara mendalam,” kata Sullivan dalam pernyataannya.
Untuk penelitian yang diterbitkan Kamis (7 April) di jurnal Sains (Buka di tab baru)Dalam studi tersebut, para peneliti menganalisis 35.000 sampel air yang diambil dari 121 lokasi di kelima lautan dunia. Para peneliti adalah bagian dari Tara Ocean Consortium, sebuah proyek global untuk mempelajari dampak dari Perubahan iklim di laut.
Para peneliti mengatakan mereka memeriksa urutan genetik yang diekstraksi dari organisme air kecil yang dikenal sebagai plankton, yang merupakan inang umum untuk virus RNA. Mereka menetapkan urutan milik virus RNA dengan mencari gen kuno yang disebut RdRp, yang ditemukan di semua virus RNA tetapi tidak ada pada virus dan sel lain. Mereka mengidentifikasi lebih dari 44.000 sekuens dengan gen ini.
Namun gen RdRp berusia miliaran tahun dan telah berevolusi berkali-kali. Karena evolusi gen berjalan jauh ke belakang, sulit bagi para peneliti untuk menentukan hubungan evolusi antara urutan. Jadi para peneliti menggunakan pembelajaran mesin untuk membantu mengaturnya.
Secara keseluruhan, mereka mengidentifikasi sekitar 5.500 spesies baru virus RNA yang termasuk dalam lima kelas yang ada, serta lima kelas baru yang diusulkan, yang oleh para peneliti diberi nama Taraviricota, Pomiviricota, Paraxenoviricota, Wamoviricota, dan Arctiviricota.
Spesies virus dalam filum Taraviricota sangat melimpah di perairan beriklim sedang dan tropis, sementara virus dalam filum Arctiviricota berlimpah di Samudra Arktik, tulis para peneliti di Percakapan. (Buka di tab baru)
Memahami bagaimana gen RdRp bervariasi dari waktu ke waktu dapat mengarah pada pemahaman yang lebih baik tentang bagaimana kehidupan awal berkembang TanahPara penulis mengatakan.
“RdRp dianggap sebagai salah satu gen tertua – itu ada sebelum DNA dibutuhkan,” kata rekan penulis studi Ahmed Zayed, seorang ilmuwan peneliti di mikrobiologi Ohio State, dalam pernyataannya. Jadi kami tidak hanya melacak asal virus, tetapi juga asal usul kehidupan.
Awalnya diterbitkan di Live Science.
More Stories
Kapan para astronot akan diluncurkan?
Perjalanan seorang miliarder ke luar angkasa “berisiko”
Administrasi Penerbangan Federal menangguhkan penerbangan SpaceX setelah roket yang terbakar jatuh saat mendarat